Načítavam moment...
Momentálne nie ste prihlásený
Genetické origami: prepis a zostrih DNA (Späť na článok)
Pridajte priamu reakciu k článku
Rozbaliť príspevokVždy som obdivoval
mladých lekárov,prírodovedcov,ktorí po skončení vysokej školy sa začali zaoberať fantastickým oborom ako Genetika je.Je hudbou budúcnosti v medicíne a prírodných vedách.
31.07.2014 18:33
| Oznám správcovi
|
Odkaz
A toto sa deje
Re: "splicing neprebieha vždy identicky". Je variabilita pripojenia exónov riadená, alebo náhodná. Akým spôsobom je zaručená funkčnosť vyrobenej bielkoviny, ak dôjde k alternatívnemu usporiadeniu exónov?
01.08.2014 10:24
| Oznám správcovi
|
Odkaz
Alternativny splicing, ktoremu podlieha drviva vacsina ludskych genov, nieje nahodny, je zlozito regulovany bielkovinami, ktore povoluju, alebo zakazuju vystrihnutie daneho intronu. Alternativne podoby bielkoviny mozu vznikat v zavislosti od tkaniva, alebo na zaklade nejakeho biochemickeho podnetu.
Tieto procesy su predmetom aktivneho vyskumu, hlbsie som ich neskumal...
Funkcnost bielkoviny nema garanta. Tym jedinym a dost nelutostnym je prirodny vyber. Alternaticny splicing samozrejme nevyraba uplne nahodne bielkoviny, tie by s najvacsou pravdepodobnostou nefungovali a to by celkovej kondicii organizmu zrejme uskodilo. Privelke preusporiadanie exonov,ci ponechanie viacerych intronov by uplne zmenilo hydrofilne a hydrofobne casti bielkoviny, tym aj jej stacanie do funkcneho tvaru.Izoformy bielkovin preto podla mna nebudu zasadne odlisne od kanonickeho (nealternativneho) prepisu do mRNA.
Proteomika je veda o bielkovinach , ktora skuma okrem ineho ich rozne izoformy - funkcne alternativy.
Tieto procesy su predmetom aktivneho vyskumu, hlbsie som ich neskumal...
Funkcnost bielkoviny nema garanta. Tym jedinym a dost nelutostnym je prirodny vyber. Alternaticny splicing samozrejme nevyraba uplne nahodne bielkoviny, tie by s najvacsou pravdepodobnostou nefungovali a to by celkovej kondicii organizmu zrejme uskodilo. Privelke preusporiadanie exonov,ci ponechanie viacerych intronov by uplne zmenilo hydrofilne a hydrofobne casti bielkoviny, tym aj jej stacanie do funkcneho tvaru.Izoformy bielkovin preto podla mna nebudu zasadne odlisne od kanonickeho (nealternativneho) prepisu do mRNA.
Proteomika je veda o bielkovinach , ktora skuma okrem ineho ich rozne izoformy - funkcne alternativy.
01.08.2014 18:58
| Oznám správcovi
|
Odkaz
:-)
dúfam, že Ťa čítajú aj moji študenti, a že si z toho aspoň kúsok zapamätajú, kým prídu na skúšku. Ja už mám tiež tendenciu zliezať na prednáškach na úroveň ZŠ a používať podobenstvá toho typu ako toto Tvoje o hladných turistoch. Dnes to už asi inak nejde.
Great job, teším sa na pokračovania. Zavesím ich na našu webstránku ako elektronické skriptá :-)
Great job, teším sa na pokračovania. Zavesím ich na našu webstránku ako elektronické skriptá :-)
01.08.2014 13:14
| Oznám správcovi
|
Odkaz
Srdecna vdaka. Je pre mna vzdy poctou, ked si clanok precitaju ludia z odboru a nenajdu tam nejake zavazne nedostatky. Snazim sa sklbit aspon zakladne odborne fakty a prelozit ich do ludskej reci, aj ked niekedy za cenu prirovnani na "urovni ZS". Myslim, ze citatelom z uplne inym zameranim to trocha pomoze a format popularizacneho blogu to znesie. Ocenim akekolvek pripomienky a doplnenie, nielen k tomuto clanku (napr. k otazkam DarkLorda ohladom alternativneho splicingu nad tymto pripevkom)...Vsetko dobre.
01.08.2014 18:30
| Oznám správcovi
|
Odkaz
presenilin-1
sice ma aj funkciu ako calcium sekvestrator v ER, ale jeho hlavna funkcia a problem pri AD je ako gamma sekretaza ovplyvnujuca Notch a APP kaskady. Tiez je kopec roznych mutacii, exon skipping je len jedna z mnohych. Vacsina (nie vsetky) presenilin 1 mutacie su skor gain of function ako loss of function a je dost mozne, ze problem s calciom (videny pri konditional knock outs, lebo ine su letalne) je skor loss of function. Tieto zvierata maju neurodegeneraciu, ale inu ako je videna pri Alzheimer's disease modeloch. Su ale dva tabory a druhy, ktory nie je amyloid centric zdoraznuje ine funkcie. Nechcem ist do detailov, len ide o to, ze presenilin 1 nie je mozno najtypickejsi priklad regulacie calciovej homeosthazy.
To len na male upresnenie, nic to nemeni na clanku, ktory je opat dobre spracovany.
To len na male upresnenie, nic to nemeni na clanku, ktory je opat dobre spracovany.
02.08.2014 0:42
| Oznám správcovi
|
Odkaz
Srdecna vdaka.
O tej konkretnej mutacii v preseniline som pisal opatrne preto, ze vynechava exon, aby pripadne citateli videli nejaky konkretny dosledok popisovaneho. Uvedomujem si, ze dovody vniku amyloid plaques a celkovo AD su ovela komplexnejsie. Iny rukolapnejsi priklad dosledkov nespravnej transkripcie ma nenapadol.
Vdaka za upresnenie.
O tej konkretnej mutacii v preseniline som pisal opatrne preto, ze vynechava exon, aby pripadne citateli videli nejaky konkretny dosledok popisovaneho. Uvedomujem si, ze dovody vniku amyloid plaques a celkovo AD su ovela komplexnejsie. Iny rukolapnejsi priklad dosledkov nespravnej transkripcie ma nenapadol.
Vdaka za upresnenie.
02.08.2014 17:49
| Oznám správcovi
|
Odkaz
Dakujem Maria za pochvalu aj K. Verim, ze citatelia Vasho FB nebudu sklamani, ze v mojich clankoch sa o Stvoritelovi vela nedocitaju... :-(
02.08.2014 17:43
| Oznám správcovi
|
Odkaz
Žiaden problém, väčšina mojich priateľov to pochopí tak, ako si prajem aby to pochopili :)
02.08.2014 21:23
| Oznám správcovi
|
Odkaz
Vdaka
velmi rada citam Vase prispevky a fascinuju ma kreativne prepojenia a pripodobnenia. Ozivuju sa mi aj spomienky na moje studium. Vsetko dobre Vam prajem.
06.08.2014 12:52
| Oznám správcovi
|
Odkaz
Tesim sa a dakujem.
V skutocnej vede si clovek taketo prirovnania a emotivne subjektivne podfarbenie faktov dovolit nemoze. Nastastie tu na blogu na poludstenie rigidnych vedeckych terminov priestor je...
V skutocnej vede si clovek taketo prirovnania a emotivne subjektivne podfarbenie faktov dovolit nemoze. Nastastie tu na blogu na poludstenie rigidnych vedeckych terminov priestor je...
07.08.2014 9:23
| Oznám správcovi
|
Odkaz
Hlavné správy
Autorská strana Samuela Marca
Ak by sa Fico a Pellegrini chceli vrátiť, nerobili by to lepšie (píše Samo Marec)
Stĺpček Jakuba Fila
Zhovievavosť voči Matovičovi už vôbec nie je namieste
Najčítanejšie
- Martin Ondráš: Ministrova pracovná metóda - vydieranie 4 203
- Peter Franek: Toto je taká blbosť, že jej ani nadpis neviem vymyslieť. 4 192
- Rudolf Pado: Chyť ma, Matovič, ak to dokážeš! 1 743
- Jaroslav Polaček: V okolí je pozitívnych viac, v meste sme na tom približne rovnako 1 661
- Ladislav Piršel: Ako by to vyzeralo, keby malo Mongolsko I. Matoviča? 1 589
- Peter Slamenik: Cibuľkovej manžel je ako Columbova žena 1 483
- Simona Kyselicová: Kúpat' sa s kosatkami? Prečo nie! 1 429
- Eva Bacigalová: Do roka a do dňa (1. časť) 1 182
- František Ivanič: Keď premiér vyhodí 498740 preferenčných hlasov cez okno. 1 098
- Michael Achberger: Vitamín D: Jeho prítomnosť je dôležitou ochranou voči chorobám, vrátane korony 809
SME si všimli
- Vladimír Krátky: Klient je úplné h***o, nevie nič !
- Veronika Svabyova: Poézia
- Silvia Smolková: Tódovej "followeri"
- Lubomir Zahora: Obchod z diplomkami.
- Jaroslav Polaček: V okolí je pozitívnych viac, v meste sme na tom približne rovnako
- Roman Hutira: Vzdelanie zadarmo má svoju cenu (Dánsko)
- Miroslav Binčík: Mrhanie zdrojmi, pohŕdanie silami. A kde je perspektíva?
- Veronika Svabyova: Radostná DSS
- Veronika Svabyova: Súrodenci
- Silvia Smolková: “Mŕtvy mafoš je dobrý mafoš. Zachvíľu budú všetci dobrí."
- Vláda sa dohodla na plošnom testovaní, predĺžila zákaz vychádzania (minúta po minúte)
- Vláda sa dohodla na celoplošnom skríningovom testovaní (minúta po minúte)
- Dokedy sa treba otestovať a čo sa zmení? (otázky a odpovede)
- Množstvo ľudí, otvorené bufety. Pozrite si Kavečany počas lockdownu
- Koronavírus: Situácia v levickej nemocnici je kritická, povoláva ambulantných lekárov (minúta po minúte)
- Pred 133 rokmi udreli extrémne mrazy, na ich meranie nestačil teplomer
- Plošné testovanie potrvá deväť dní, vláda predĺžila aj zákaz vychádzania
- Vlhová predviedla kvalitnú jazdu, v Kranjskej Gore môže útočiť na triumf
- Vlhová predviedla kvalitnú jazdu, v Kranjskej Gore môže útočiť na triumf
- Shiffrinová nastavila latku vysoko, Vlhová stráca po prvom kole priveľa
- Shiffrinová nastavila latku vysoko, Vlhová stráca po prvom kole priveľa
- Cez čiaru: Ktorí vplyvní ľudia dláždili cestu Haščákovi a Pente?
- Chôdza ako terapia aj šport. Ako ňou chudnúť aj meditovať?
- Vlhová tesne prišla o pódium, na svoju rivalku stratila iba dvanásť stotín
- Vlhová tesne prišla o pódium, na svoju rivalku stratila iba dvanásť stotín
- Prieskum: Sme rodina je len tesne nad hranicou zvoliteľnosti
- Vlhová sa nevyhla chybám, sama nebola spokojná. Vyhrala znovu Bassinová
- Vlhová sa nevyhla chybám, sama nebola spokojná. Vyhrala znovu Bassinová
- Vláda sa dohodla na testovaní, ale nestihla k nemu napísať uznesenie
- Vlhová pôjde na trať pred topfavoritkou, Shiffrinová ako posledná z elitnej skupiny
Polymeráza
zaujímalo by ma ako vie polymeráza, na ktorý gén sa má pripojiť vyrobiť mRNA?
1. promoter genu je dostupny a mozu sa na neho naviazat. Expresia genov je prakticky vzdy regulovana pomerne zlozitymi regulacnymi sekvenciami, ktore predchadzaju samotnemu promoteru genu a bunka tak dokaze usmernovat, kedy sa aky hormon ma tvorit (napr. enzym laktazu potrebujeme ked skonzumujeme mieko,inokedy ani nie). Geny sa riadia aj navzajom - aktivita/neaktivita jedneho vyvola aktivitu/neaktivitu ineho(toto sa vola epistaza, akoby orchestracia genov a je predmetom intenzivneho vyskumu).
2. gen je dostupny na citanie - DNA je totiz v jadre sofistikovane spakovana a na prepis su dostupne menej spakovane casti. Roznymi modifikaciami spakovania (histonove modifikacie) je mozne ovplyvnit uroven spakovania DNA v mieste daneho genu a tym riadit moznost jeho prepisu do mRNA. Napriklad jeden zo zenskych X chromozomov (v kazdej bunke nahodny z dvojice) je tak intenzivne takymito epigenetickymi modifikaciami spakovany, ze sa pocas celeho zivota z neho (skoro) nic necita. Vsetkych 1000+ genov X chromozomu sa cita z tej druhej kopie.