Načítavam moment...
Momentálne nie ste prihlásený
Ako 100x prepísať Bibliu a zameniť len jediné písmeno (Späť na článok)
Pridajte priamu reakciu k článku
Hodnoť
Rozbaliť príspevok
no ved dalsi mimozemstania :)
Reagovať
|
tricky
tricky
07.09.2014 12:02
| Oznám správcovi
|
Odkaz
no pisari z tiberijskej a jeruzalemskej bnei masora mali okrem polymerazovej aktivity aj vcelku uspesnu exonukleazovu cinnost ;)
vedeli ze musia mat 79847 slov a 304805 pismen, pricom chyba v co i len jednom pismene (pridal, zabudol, dotykalo sa ineho, vyzeralo ako ine) znamenala, ze cely text (na ktorom ta chyba bola) sa musel vystrihnut a na jeho miesto sa musel nalepit novy kozeny zvitok. ich chybovost pri porovnavani 1000r divergentnych textov sa odhaduje na 4x10^-5, teda 4 chyby na 100 000 pismen co v porovnani s chybovostou dna polymerazy (10^-8) vychadza zhruba 1000x v neprospech stredovekych skrabacov. to zase nie je az tak zle, nie? ;)
co mna fascinuje je trade off medzi chybovostou polymerazy/proofreadingom ako zdroja mutacii/variability a tlakom na fidelitu kopirovania. inymi slovami - ak by bola polymeraza uplne bezchybna, vznik mutacii by bol odkazany len na enviromentalne zdroje a variabilita populacii by drasticky klesla. selekcia by nemala z coho selektovat a takato staza by zrejme viedla k extinkcii, lebo vsak kde nic nie je ani prirodzena selekcia neberie.
ono to vsak vyzera, ze polymerazy by kludne mohli byt este 10 000x presnejsie nez su http://www.genetics.org/conten... (teda chybovost by bola 10^-12!) a to i bez vsetkych tych nabalenych reparacnych enzymov. fakt, ze nie su znamena tri veci - bud nie je energeticky unosna, netreba ju alebo sluzi ako pool z ktoreho si fisher http://en.wikipedia.org/wiki/R... vybera. teda ze samotna chybovost polymerazy je ziaduca (v prikrom kontraste k stredovekym kopistom) a sluzi ako generator biologickej variability.
a to je aj vedlajsi dovod, preco je kvalita replikacie dna tak striktne kontrolovana v porovnani az s bezprizornostou transkripcie a translacie kde chyby ani nevadia a ani povacsine nemaju hlbsi evolucny vyznam.
vedeli ze musia mat 79847 slov a 304805 pismen, pricom chyba v co i len jednom pismene (pridal, zabudol, dotykalo sa ineho, vyzeralo ako ine) znamenala, ze cely text (na ktorom ta chyba bola) sa musel vystrihnut a na jeho miesto sa musel nalepit novy kozeny zvitok. ich chybovost pri porovnavani 1000r divergentnych textov sa odhaduje na 4x10^-5, teda 4 chyby na 100 000 pismen co v porovnani s chybovostou dna polymerazy (10^-8) vychadza zhruba 1000x v neprospech stredovekych skrabacov. to zase nie je az tak zle, nie? ;)
co mna fascinuje je trade off medzi chybovostou polymerazy/proofreadingom ako zdroja mutacii/variability a tlakom na fidelitu kopirovania. inymi slovami - ak by bola polymeraza uplne bezchybna, vznik mutacii by bol odkazany len na enviromentalne zdroje a variabilita populacii by drasticky klesla. selekcia by nemala z coho selektovat a takato staza by zrejme viedla k extinkcii, lebo vsak kde nic nie je ani prirodzena selekcia neberie.
ono to vsak vyzera, ze polymerazy by kludne mohli byt este 10 000x presnejsie nez su http://www.genetics.org/conten... (teda chybovost by bola 10^-12!) a to i bez vsetkych tych nabalenych reparacnych enzymov. fakt, ze nie su znamena tri veci - bud nie je energeticky unosna, netreba ju alebo sluzi ako pool z ktoreho si fisher http://en.wikipedia.org/wiki/R... vybera. teda ze samotna chybovost polymerazy je ziaduca (v prikrom kontraste k stredovekym kopistom) a sluzi ako generator biologickej variability.
a to je aj vedlajsi dovod, preco je kvalita replikacie dna tak striktne kontrolovana v porovnani az s bezprizornostou transkripcie a translacie kde chyby ani nevadia a ani povacsine nemaju hlbsi evolucny vyznam.
07.09.2014 14:29
| Oznám správcovi
|
Odkaz
Pjotr
Srdecna vdaka za hodnotny prispevok ako vzdy...
O checksumoch a dokladnosti zidovskych kopirovacov tory som diskutoval s kolegom, ktoreho to tiez velmi zaujima a rozprava mi rozne zaujimavosti z tejto oblasti. Uz ho nejaku dobu lamem na to, aby tiez nieco spisal na blog, lebo su to veci, ktore malokto vie. Ci uz ide o starozakonne, alebo novozakonne fakty. Niekedy detaily pochopene v spravnom kontexte/preklade menia dost zasadne vyznam posolstva.
No ale k biologii.
Ad polymerase fidelity: ten tradeoff je zaujimavy, lebo na urovni jedinca presnejsia replikacia skor zvysuje fitness a teraz ma nenapada dovod,preco by sa presnost polymerazy na urcitej hodnote zastavila. Je zrejme nutne hladiet na to na urovni celych populacii (Fishera) a ich diverzite, nie na urovni jedinca.
Ad proofreading: Na wiki sa pri proofreadingu na moje prekvapenie spomina aj translacia: "Proofreading also occurs in mRNA translation for protein synthesis. In this case, one mechanism is release of any incorrect aminoacyl-tRNA prior to peptide bond formation". Preto som ani v clanku striktne netvrdil, ze pri transkripcii a translacii neprebieha.
O checksumoch a dokladnosti zidovskych kopirovacov tory som diskutoval s kolegom, ktoreho to tiez velmi zaujima a rozprava mi rozne zaujimavosti z tejto oblasti. Uz ho nejaku dobu lamem na to, aby tiez nieco spisal na blog, lebo su to veci, ktore malokto vie. Ci uz ide o starozakonne, alebo novozakonne fakty. Niekedy detaily pochopene v spravnom kontexte/preklade menia dost zasadne vyznam posolstva.
No ale k biologii.
Ad polymerase fidelity: ten tradeoff je zaujimavy, lebo na urovni jedinca presnejsia replikacia skor zvysuje fitness a teraz ma nenapada dovod,preco by sa presnost polymerazy na urcitej hodnote zastavila. Je zrejme nutne hladiet na to na urovni celych populacii (Fishera) a ich diverzite, nie na urovni jedinca.
Ad proofreading: Na wiki sa pri proofreadingu na moje prekvapenie spomina aj translacia: "Proofreading also occurs in mRNA translation for protein synthesis. In this case, one mechanism is release of any incorrect aminoacyl-tRNA prior to peptide bond formation". Preto som ani v clanku striktne netvrdil, ze pri transkripcii a translacii neprebieha.
07.09.2014 23:11
| Oznám správcovi
|
Odkaz
no, ja si myslím,
že nie všetky chyby sú chybami. Niektoré zmeny sú proste vedomým zápisom prospešných, životaschopných prispôsobení. Ale vyžaduje to predpokladať určité, nie všeobecne prijímané predstavy. Napr, že jednotlivé bunky, ale aj molekuly a možno ešte elementárnejšie častice hmoty majú vlastnú inteligenciu. Napr: že živý organizmus je spoločenstvo spolupracujúcich "jedincov", ktorí majú záujem vylepšovať fungovanie celku, či už v rámci holého prežitia, alebo lepšieho nažívania. Jednoducho povedané, Lamarck je bližšie než Darwin. Mnohé by to vysvetľovalo, i keď uznávam, že zatiaľ sa to nedá merať...
09.09.2014 21:21
| Oznám správcovi
|
Odkaz
Hlavné správy
Komentár Zuzany Kepplovej
Hluchá linka, nefunkčná appka
Najčítanejšie
- Peter Franek: Toto je taká blbosť, že jej ani nadpis neviem vymyslieť. 25
- Adrián Vološin: Aj vykastrovaný lockdown zaberá, ale premierovi to nehrá do karát celoplošného testovania 24
- Peter Slamenik: Cibuľkovej manžel je ako Columbova žena 23
- Eva Bacigalová: Do roka a do dňa (1. časť) 11
- Ľuboslava Šusteková: Huspenina 11
- Marian Baran: Cez čiaru 9
- Miro Koseček: Prestaňte pľuť na Gretu 8
- Silvia Smolková: Tódovej "followeri" 8
- Jaroslav Polaček: V okolí je pozitívnych viac, v meste sme na tom približne rovnako 8
- Filip Olekšák: #chrantesvojebabky 6
SME si všimli
- Silvia Smolková: Tódovej "followeri"
- Lubomir Zahora: Obchod z diplomkami.
- Jaroslav Polaček: V okolí je pozitívnych viac, v meste sme na tom približne rovnako
- Roman Hutira: Vzdelanie zadarmo má svoju cenu (Dánsko)
- Miroslav Binčík: Mrhanie zdrojmi, pohŕdanie silami. A kde je perspektíva?
- Veronika Svabyova: Radostná DSS
- Veronika Svabyova: Súrodenci
- Silvia Smolková: “Mŕtvy mafoš je dobrý mafoš. Zachvíľu budú všetci dobrí."
- Ján Škerko: Moje spomienky na Dunaj v Bratislave
- Lukáš Baloga: Odložené dlhy by mohli spôsobiť ďalšiu finančnú krízu
- Vláda sa dohodla na plošnom testovaní, predĺžila zákaz vychádzania (minúta po minúte)
- Vláda sa dohodla na celoplošnom skríningovom testovaní (minúta po minúte)
- Koronavírus na Slovensku: Celoplošné testovanie je zásah s najrýchlejším účinkom, tvrdí Krajčí (minúta po minúte)
- Množstvo ľudí, otvorené bufety. Pozrite si Kavečany počas lockdownu
- Koľko vakcíny nemocnice vyhodia? Priznala sa len Bratislava
- Väzenský psychológ: Nemám pochybnosť o tom, že Lučanský spáchal samovraždu
- Pred 133 rokmi udreli extrémne mrazy, na ich meranie nestačil teplomer
- Vlhová predviedla kvalitnú jazdu, v Kranjskej Gore môže útočiť na triumf
- Shiffrinová nastavila latku vysoko, Vlhová stráca po prvom kole priveľa
- Cez čiaru: Ktorí vplyvní ľudia dláždili cestu Haščákovi a Pente?
- Radačovský ukázal nový dôkaz v kauze Lučanského. Nájsť ho mal za stieračmi
- Vlhová tesne prišla o pódium, na svoju rivalku stratila iba dvanásť stotín
- Chôdza ako terapia aj šport. Ako ňou chudnúť aj meditovať?
- Vláda sa dohodla na testovaní, ale nestihla k nemu napísať uznesenie
- Vlhová sa nevyhla chybám, sama nebola spokojná. Vyhrala znovu Bassinová
- Vlhová pôjde na trať pred topfavoritkou, Shiffrinová ako posledná z elitnej skupiny
- Polícia pokutu päťsto eur za cestu po drevo na kúrenie obhajuje
- Milióny na IT z čias Žigu sú ukážkovým plytvaním, na ťahu je NAKA
- Sedemdňový priemer z PCR testov klesá (mapy a grafy)
- Z paralelnej reality, v ktorej premiér uviazol, sa nemá šancu vymotať (týždeň podľa Schutza)
